MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 2789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018023	CGA	2	6	29499	29504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406294
502	NC_018023	CCG	2	6	29526	29531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406294
503	NC_018023	TCG	2	6	29576	29581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406295
504	NC_018023	TCG	2	6	29590	29595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406295
505	NC_018023	GCA	2	6	29614	29619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406295
506	NC_018023	GAC	2	6	29694	29699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406295
507	NC_018023	TGC	2	6	29746	29751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406295
508	NC_018023	CGAG	2	8	29775	29782	25 %	0 %	50 %	25 %	392406295
509	NC_018023	ATC	2	6	29787	29792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406295
510	NC_018023	CGGC	2	8	29938	29945	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
511	NC_018023	TGGG	2	8	29953	29960	0 %	25 %	75 %	0 %	392406295
512	NC_018023	GTCA	2	8	29976	29983	25 %	25 %	25 %	25 %	392406295
513	NC_018023	GCG	2	6	30006	30011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406295
514	NC_018023	ACG	2	6	30022	30027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406295
515	NC_018023	GAGACG	2	12	30117	30128	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392406295
516	NC_018023	TCG	2	6	30169	30174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406295
517	NC_018023	AAG	2	6	30175	30180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406295
518	NC_018023	CA	3	6	30300	30305	50 %	0 %	0 %	50 %	392406295
519	NC_018023	GAG	2	6	30342	30347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406295
520	NC_018023	CGC	2	6	30509	30514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406295
521	NC_018023	TTG	2	6	30598	30603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406295
522	NC_018023	GAAG	2	8	30620	30627	50 %	0 %	50 %	0 %	392406295
523	NC_018023	GTG	3	9	30639	30647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406295
524	NC_018023	ACA	2	6	30717	30722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406295
525	NC_018023	TTC	2	6	30769	30774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392406295
526	NC_018023	CGCAC	2	10	30818	30827	20 %	0 %	20 %	60 %	392406295
527	NC_018023	GC	3	6	30870	30875	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
528	NC_018023	CCG	2	6	30897	30902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406295
529	NC_018023	GGA	2	6	30929	30934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406295
530	NC_018023	CGC	2	6	30966	30971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406295
531	NC_018023	CTC	2	6	31001	31006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406295
532	NC_018023	CGA	2	6	31010	31015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406295
533	NC_018023	CGATGT	2	12	31022	31033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392406295
534	NC_018023	GCCG	2	8	31040	31047	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
535	NC_018023	CGC	2	6	31127	31132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406295
536	NC_018023	GGA	2	6	31136	31141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406295
537	NC_018023	CGG	2	6	31160	31165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406295
538	NC_018023	TCG	2	6	31207	31212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406295
539	NC_018023	CGA	2	6	31283	31288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406295
540	NC_018023	GCG	2	6	31369	31374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406295
541	NC_018023	CG	4	8	31373	31380	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
542	NC_018023	CGT	2	6	31415	31420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406295
543	NC_018023	GCG	2	6	31494	31499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406295
544	NC_018023	TCC	2	6	31530	31535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406295
545	NC_018023	TCA	2	6	31646	31651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406296
546	NC_018023	ACG	2	6	31684	31689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
547	NC_018023	ACG	2	6	31721	31726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
548	NC_018023	ACG	2	6	31766	31771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
549	NC_018023	CAT	2	6	31842	31847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406296
550	NC_018023	CGG	2	6	31866	31871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406296
551	NC_018023	ATC	2	6	31891	31896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406296
552	NC_018023	ACT	2	6	31901	31906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406296
553	NC_018023	TCG	2	6	31998	32003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406296
554	NC_018023	GC	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	392406296
555	NC_018023	CAA	2	6	32052	32057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406296
556	NC_018023	CGC	3	9	32094	32102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406296
557	NC_018023	ACG	2	6	32120	32125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
558	NC_018023	CAT	2	6	32202	32207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406296
559	NC_018023	CGA	2	6	32214	32219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
560	NC_018023	GATG	2	8	32274	32281	25 %	25 %	50 %	0 %	392406296
561	NC_018023	CTG	2	6	32310	32315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406296
562	NC_018023	ACT	2	6	32321	32326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406296
563	NC_018023	GGA	2	6	32349	32354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406296
564	NC_018023	GAT	2	6	32497	32502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406296
565	NC_018023	TCG	2	6	32540	32545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406296
566	NC_018023	CGA	2	6	32586	32591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
567	NC_018023	AAC	2	6	32636	32641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406296
568	NC_018023	GCAC	2	8	32703	32710	25 %	0 %	25 %	50 %	392406296
569	NC_018023	GCA	2	6	32722	32727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
570	NC_018023	GCA	2	6	32751	32756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
571	NC_018023	GCA	2	6	33192	33197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406297
572	NC_018023	CCGT	2	8	33333	33340	0 %	25 %	25 %	50 %	392406297
573	NC_018023	GCGG	2	8	33400	33407	0 %	0 %	75 %	25 %	392406297
574	NC_018023	TCG	2	6	33476	33481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406297
575	NC_018023	GCC	2	6	33562	33567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406297
576	NC_018023	GTC	2	6	33592	33597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406297
577	NC_018023	TAC	2	6	33598	33603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406297
578	NC_018023	GAG	2	6	33643	33648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406297
579	NC_018023	AGA	2	6	33666	33671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406297
580	NC_018023	TGGA	2	8	33727	33734	25 %	25 %	50 %	0 %	392406297
581	NC_018023	TCG	2	6	33737	33742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406297
582	NC_018023	TCG	2	6	33943	33948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406297
583	NC_018023	GTGG	2	8	33960	33967	0 %	25 %	75 %	0 %	392406297
584	NC_018023	CCT	2	6	34043	34048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406297
585	NC_018023	TCG	2	6	34243	34248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406298
586	NC_018023	ACG	2	6	34291	34296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406298
587	NC_018023	TTC	2	6	34299	34304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392406298
588	NC_018023	CGA	2	6	34316	34321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406298
589	NC_018023	CGAC	2	8	34352	34359	25 %	0 %	25 %	50 %	392406298
590	NC_018023	TAC	2	6	34407	34412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406298
591	NC_018023	CGAGAT	2	12	34436	34447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392406298
592	NC_018023	TCC	2	6	34459	34464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406298
593	NC_018023	GTT	2	6	34552	34557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406299
594	NC_018023	GC	3	6	34597	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	392406299
595	NC_018023	CCCGA	2	10	34603	34612	20 %	0 %	20 %	60 %	392406299
596	NC_018023	CAT	2	6	34629	34634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406299
597	NC_018023	C	6	6	34635	34640	0 %	0 %	0 %	100 %	392406299
598	NC_018023	TGC	2	6	34667	34672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406299
599	NC_018023	CGG	2	6	34716	34721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406299
600	NC_018023	CGTT	2	8	34734	34741	0 %	50 %	25 %	25 %	392406299
601	NC_018023	CGCAA	2	10	34744	34753	40 %	0 %	20 %	40 %	392406299
602	NC_018023	GAA	2	6	34860	34865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406299
603	NC_018023	CGA	2	6	34902	34907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406299
604	NC_018023	TAC	2	6	34945	34950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406299
605	NC_018023	GAA	2	6	34953	34958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406299
606	NC_018023	GGCT	2	8	34971	34978	0 %	25 %	50 %	25 %	392406299
607	NC_018023	GTG	2	6	35122	35127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406299
608	NC_018023	TGA	2	6	35234	35239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406299
609	NC_018023	GTC	2	6	35398	35403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406299
610	NC_018023	GAC	2	6	35404	35409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406299
611	NC_018023	TCG	2	6	35411	35416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406299
612	NC_018023	GCC	2	6	35454	35459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406299
613	NC_018023	GACC	2	8	35553	35560	25 %	0 %	25 %	50 %	392406299
614	NC_018023	CGG	2	6	35622	35627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406299
615	NC_018023	CGT	2	6	35660	35665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406299
616	NC_018023	TTG	2	6	35677	35682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406299
617	NC_018023	GCC	2	6	35700	35705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406299
618	NC_018023	AAG	2	6	35785	35790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406299
619	NC_018023	TCAACC	2	12	35825	35836	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392406299
620	NC_018023	CGA	2	6	35837	35842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406299
621	NC_018023	TGG	2	6	35863	35868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406299
622	NC_018023	CGA	2	6	35985	35990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406299
623	NC_018023	CGG	2	6	35995	36000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406299
624	NC_018023	GA	3	6	36207	36212	50 %	0 %	50 %	0 %	392406300
625	NC_018023	CGG	2	6	36268	36273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406300
626	NC_018023	GCA	2	6	36276	36281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406300
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630	NC_018023	GTC	2	6	36407	36412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406300
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750	NC_018023	TGC	2	6	43595	43600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406304
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752	NC_018023	CGA	2	6	43667	43672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406304
753	NC_018023	TCG	2	6	43741	43746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406304
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873	NC_018023	GTCG	2	8	52255	52262	0 %	25 %	50 %	25 %	392406310
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877	NC_018023	TCC	2	6	52601	52606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406311
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1000	NC_018023	ACC	2	6	59257	59262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406320

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